en las jefaturas de manejan los programas administrativos, los problemas de los alumnos y las relaciones con los profesores, con el fin de transmitirselos a las directivas. hay varias jefaturas de departamento estas son:
derecho, economía, administración de empresas, contaduría, enfermería, instrumentación quirúrgica, microbiología, comercio internacional, sociología, ingeniería de sistemas, ingeniería electrónica, ingeniería agroindustrial, ingeniería ambiental, licenciatura en matemática y física, licenciatura en ciencias naturales, licenciatura en lengua castellana e inglés, licenciatura en arte y folclor